Qu'est-ce que le test en piscine pour COVID-19 et en quoi est-il différent des tests de coronavirus actuels?

Les États-Unis continuent de voir une augmentation du nombre de cas de COVID-19, et la hausse a conduit les responsables à repenser la stratégie de dépistage actuelle du pays et à trouver de nouvelles façons de déterminer combien de personnes ont été exposées. au virus.
Dans une brève interview rapportée par le New York Times vendredi, Anthony Fauci, MD, directeur de l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses a admis que l'approche actuelle des États-Unis consistant à ne tester que les personnes qui afficher les symptômes du COVID-19, les isoler et tracer leurs contacts ne fonctionne pas. Cet échec, a-t-il dit, est dû à deux choses: que certaines personnes sont asymptomatiques et propagent le virus sans le savoir, et que d'autres sont réticentes ou incapables de s'auto-mettre en quarantaine après une exposition au virus.
Pour remédier à ce défaut actuel approche, le Dr Fauci a déclaré que les responsables avaient des «discussions intenses» sur un éventuel passage aux «tests en piscine». Voici ce que vous devez savoir sur la stratégie de test proposée et sur la manière dont elle pourrait aider à déterminer et à contenir les épidémies de COVID-19.
Les tests en pool reposent sur la même technologie de réaction en chaîne par polymérase (PCR) que les tests de diagnostic individuels, mais la méthode par laquelle les personnes sont testées est assez différente de l'approche de test standard qui a été utilisée jusqu'à présent, a déclaré l'expert en maladies infectieuses Amesh A. Adalja, MD, chercheur principal au Johns Hopkins Center for Health Security dans le Maryland, Santé.
«La méthode de test en piscine combine des échantillons provenant de plusieurs personnes afin de réaliser un test sur l'ensemble du lot», dit-il. "Cela signifie que si le résultat est positif, il est impossible de savoir quel échantillon individuel en était responsable." Mais si un pool obtient un résultat positif, il peut passer à une deuxième phase de test, qui décompose le pool en échantillons plus petits pour identifier la ou les personnes infectées.
«Pensez-y comme le premier appel de« tout le monde dans la piscine »et 30 sauts puis vient« nager uniquement pour les adultes »et 25 sortent. Les cinq autres sont ensuite testés au lieu des 30 », explique à Health, l'expert en santé publique Carol A. Winner, MPH, experte en santé publique et fondatrice du mouvement de distanciation personnelle Give Space.
Les tests en piscine présentent de nombreux avantages, déclare Winner. Pour commencer, cela peut être plus rentable et empêcher les laboratoires de se surcharger. Il peut également éliminer un grand nombre de personnes qui ne sont pas infectées mais qui auraient autrement pu subir un test individuel et agir comme une sorte de système de surveillance pour les personnes asymptomatiques. Les tests en pool accélèrent également le processus de test car cela prend beaucoup moins de temps que d'obtenir un échantillon d'un individu et de le soumettre ensuite à tous les processus de laboratoire nécessaires.
«La mise en commun nous donnerait la capacité de passer de un demi-million de tests par jour à potentiellement cinq millions d'individus testés par jour », a déclaré Deborah Birx, MD, coordinatrice du groupe de travail sur le coronavirus de la Maison Blanche, lors d'une conférence virtuelle de l'American Society for Microbiology cette semaine, comme le rapporte STAT News.
Bien que les tests en piscine soient plus rentables et prennent moins de temps, ce n'est pas une approche infaillible. S'il y a trop de personnes infectées dans l'échantillon initial, il peut être impossible de les identifier dans le groupe. «Si la prévalence est élevée, tous les lots seront positifs et ils seront moins utiles», dit le Dr Adalja.
«Les échantillons peuvent également être moins viables si le pool est trop grand, car les diluer avec de grands nombres peut faire apparaître certains cas positifs comme négatifs», explique Winner.
Les tests en piscine sont plus adaptés à certaines régions des États-Unis qu'à d'autres, en raison des variations de prévalence de la maladie. Par exemple, ce n'est peut-être pas la meilleure approche au Texas ou en Arizona, où des niveaux records de nouveaux cas ont été signalés. D'un autre côté, cela pourrait bien fonctionner dans le New Jersey ou le New Hampshire, où les cas sont à la baisse.
Le nombre d'échantillons de personnes pouvant être regroupés dépend de la machine utilisée pour le test, et les opinions des scientifiques varient. Certains disent que jusqu'à 10 échantillons pourraient être regroupés dans certains cas, tandis que d'autres recommandent des quantités de chiffres uniques allant jusqu'à 50, dit Winner. Cependant, une étude pré-imprimée en Israël qui n'a pas encore été examinée par des pairs) a révélé que le virus était détectable dans un pool aussi grand que 64.
Winner pense que le test en pool est la bonne approche dans les endroits où faibles taux de COVID-19, où l'on s'attendrait à ce que la grande majorité des tests soient négatifs - sinon, trop de pools reviendraient positifs pour que la méthode fonctionne.
"Le confinement est notre meilleur défense dans le contrôle de la propagation du COVID-19, nous devons donc savoir qui l'a, et les tests doivent inclure ceux qui ne présentent pas de symptômes », dit Winner. "Pour contenir la propagation du virus, il faut tester l'infection, rechercher les contacts pour toute personne susceptible d'être exposée à ceux qui sont infectés et isoler ensuite tous ceux qui sont infectés."