Le test des eaux usées du coronavirus est-il la clé pour ralentir la propagation du COVID-19? Voici ce que disent les experts

Une clé pour ralentir la propagation du COVID-19 pourrait-elle être dans notre merde? Potentiellement, oui. Des scientifiques à travers les États-Unis mènent actuellement des tests sur les eaux usées des coronavirus: ils prélèvent des échantillons de déchets humains dans les stations d'épuration et les analysent pour détecter les particules virales. Si un grand nombre d'échantillons fécaux sont testés positifs pour le virus dans une communauté spécifique, les responsables de la santé pourraient alors prendre des mesures au niveau local pour aider à prévenir une épidémie.

La société Biobot, basée à Boston, se décrit comme «la première entreprise dans le monde pour commercialiser les données des eaux usées », s'est associée à des chercheurs du MIT, de Harvard et du Brigham and Women's Hospital pour lancer un programme pro bono qui cartographie le COVID-19 à travers le pays. À ce jour, Biobot travaille avec environ 330 installations dans 40 États, ce qui représente environ 10% de la population américaine.

La société a lancé son programme après que des études ont montré que le SARS-CoV-2, le virus responsable du COVID-19, est présent dans les matières fécales (les Centers for Disease Control and Prevention confirment que le virus a été trouvé dans les selles de certains patients diagnostiqués avec le COVID-19), et se rassemble donc dans les égouts de la ville.

Alors que les chercheurs savent depuis les premiers stades de la nouvelle pandémie de coronavirus que l'agent pathogène est présent dans les matières fécales, le but est maintenant de déterminer exactement combien il en existe, pour donner une image plus claire des niveaux d'infection dans la population générale.

Selon Biobot, le nombre de personnes infectées par COVID-19 pourrait être beaucoup plus élevé que ne le suggèrent les chiffres officiels. Les données préliminaires, publiées sur le référentiel de pré-impression medRxiv le 7 avril, ont révélé que dans une grande région métropolitaine du Massachusetts avec 446 cas signalés, leur méthode basée sur les eaux usées a identifié jusqu'à 115000 cas non signalés non connus des responsables de la santé. .

«Nous commençons le processus en envoyant des kits d'échantillonnage aux établissements participants à travers les États-Unis. Ces usines de traitement sont chargées de collecter des échantillons composites 24 heures sur 24 et de les renvoyer à Biobot pour analyse », explique Mariana Matus, PhD, PDG et cofondatrice de Biobot, à Health. Au laboratoire, l'équipe Biobot traite les échantillons d'eaux usées, puis utilise une technique appelée protocole RT-PCR pour détecter le virus SARS-CoV-2. Les résultats des tests sont communiqués aux communautés participantes via un rapport hebdomadaire.

«Là où le virus est détecté, nous fournirons une estimation de la prévalence de l'infection dans le bassin testé», explique le Dr Matus. «Le délai d'exécution des données est généralement de cinq jours. Il est très important pour notre équipe de récupérer les données analysées la semaine même où l'échantillon a été collecté, car la portée des données change si rapidement. "

Pendant ce temps, des chercheurs d'autres pays ont publié des résultats prometteurs issus de tests similaires. Une équipe parisienne a échantillonné les eaux usées pendant plus d'un mois, observant une augmentation et une baisse du SRAS-CoV-2 qui correspondaient à la forme de l'épidémie de COVID-19 dans la région (qui reste sous verrouillage). Les chercheurs ont déclaré que leur étude, publiée sur medRxiv le 17 avril, était la première à montrer que le test pouvait détecter une forte augmentation des concentrations virales dans les eaux usées avant que des cas n'éclatent dans les établissements de santé.

«L'égout donne des épidémies en temps réel», explique l'expert en santé publique Carol A. Winner, MPH, qui a dirigé plusieurs initiatives de santé communautaire financées par le gouvernement fédéral et fondé le mouvement Give Space en 2017, Santé . «Les matières fécales et l'urine sont constamment collectées pour étude et bien que le coronavirus se dissipe rapidement, les scientifiques sont en mesure de trouver des particules microscopiques d'ARN à partir du virus. Cela permet aux spécialistes de l'environnement de commencer à établir un lien entre les niveaux d'épidémie et les niveaux échantillonnés dans les eaux usées. »

En tant que moyen relativement peu coûteux et non invasif d'identifier et de mettre en garde contre de futures épidémies, les analyses des eaux usées pourraient fournir suffisamment d'informations pour guider les décisions sur les stratégies de protection et de prévention, telles que la distanciation sociale.

«Les données que nous trouvons permettent aux communautés locales et aux gouvernements de mesurer l'ampleur de l'épidémie et de prendre des mesures», déclare le Dr Matus. "Comme nous trouvons constamment des résultats d'un ordre de grandeur supérieur à ce qui a été testé cliniquement, même dans nos estimations les plus prudentes, nous apprenons qu'il existe une grande population asymptomatique ou peu symptomatique."

Dr . Matus estime que les tests des eaux usées devraient être utilisés parallèlement à d'autres méthodes de test pour aider à suivre l'efficacité des interventions prises et à fournir des alertes précoces en cas de réémergence du coronavirus, s'il a effectivement un cycle saisonnier.

«Les spécialistes de la santé peuvent utiliser ce type d'informations comme une autre pièce du puzzle pour prendre des décisions en matière de prévention et de préparation», déclare Winner. «Si les écologistes détectent un pic de concentrations du coronavirus dans le système d'égouts, cela signale la nécessité de poursuivre la distanciation sociale et une éventuelle quarantaine et les avertit de renforcer la préparation médicale. S'ils constatent une baisse des concentrations, cela pourrait influencer positivement la cartographie de l'assouplissement des restrictions. »

Jusqu'à ce que les données des analyses des eaux usées soient examinées par des pairs, cependant, on ne sait pas dans quelle mesure les informations sont valides. Winner souligne également qu'il reste encore beaucoup à apprendre sur le nouveau coronavirus. «Cependant, la surveillance environnementale des systèmes d'égouts est en place et constante, de sorte que la pratique technique elle-même offre un niveau de fiabilité», dit-elle.

Dr. Matus estime que le potentiel de collecte de données sur les eaux usées est énorme. Biobot a développé des kits matériels permettant de prélever des échantillons directement sur les canalisations d'égout. «Nous travaillons à faire évoluer la technologie pour la rendre plus largement disponible», dit-elle. «À terme, la possibilité de tester des conduites spécifiques ou à des points spécifiques de l'égout nous aidera à identifier des populations spécifiques au sein d'une communauté plus large.»