Les antibiotiques peuvent tuer des bactéries saines dans l'intestin

La plupart des bactéries qui vivent dans les intestins d'une personne en bonne santé rebondiront immédiatement après avoir été tuées lors d'une attaque aux antibiotiques, selon une nouvelle étude.

Mais plusieurs types sont éliminés par un cours de Cipro, ou ils ne survivent qu'en bien plus petit nombre, rapporte Les Dethlefsen, PhD de l'Université de Stanford, et ses collègues dans le numéro de ce mois-ci de la revue PLoS Biology.

Dans l'ensemble, environ 30% des types de bactéries trouvés dans l'intestin a montré des changements de population dramatiques après un cours de ciprofloxacine. La majorité des bactéries ont rebondi quatre semaines plus tard.

«Nous n'avons aucune idée des conséquences de cela», dit Dethlefsen. Aucun des trois volontaires sains participant à l'étude n'est tombé malade, mais l'altération de leur écosystème bactérien pourrait avoir des effets à plus long terme et plus subtils, ajoute-t-il.

Les bogues dans les intestins humains sont un sujet brûlant ces jours-ci. . Les probiotiques peuvent être utilisés pour coloniser les intestins avec des microbes «gentils». Bien que le jury se demande si ces suppléments ont un effet sur l'environnement bactérien de l'intestin, il est clair que ne pas avoir une communauté microbienne florissante dans ses intestins peut être dangereux, avec des conséquences allant d'un jour ou deux de diarrhée à une infection potentiellement mortelle par un méchant bug appelé Clostridium difficile, qui peut s'implanter chez les patients traités avec des antibiotiques.

«Nous avons une communauté microbienne très complexe et diversifiée qui vit dans nos tripes et fait toutes sortes de choses incroyables pour nous, »Dit Dethlefsen. Non seulement les bactéries aident à digérer les aliments et à extraire les nutriments des aliments, mais elles protègent également des infections, aident à réguler le système immunitaire et peuvent même avoir leur mot à dire sur le moment de la naissance.

Dans l'étude actuelle , Dethlefsen et son équipe ont utilisé une technique appelée pyroséquençage pour prendre un décompte microbien des échantillons de selles des participants à l'étude avant qu'ils ne prennent un cours court de ciprofloxacine; puis les chercheurs ont prélevé quatre autres échantillons au cours des huit mois suivants. La technique consiste à lire une section spécifique du matériel génétique de chacun des centaines de milliers de microbes, ce qui permet d'identifier plusieurs des milliers d'organismes différents présents dans l'intestin et de déterminer leur abondance relative.

Le les chercheurs ont repéré jusqu'à 5 700 types de bactéries chez chaque personne avant l'administration de l'antibiotique. Après que les volontaires aient pris Cipro, les populations de punaises intestinales étaient très différentes. Dans l'ensemble, 30% des types bactériens ont montré des changements spectaculaires dans leur population. Un volontaire de l'étude a eu une réduction de 82% de la diversité de sa microflore intestinale; un avait perdu 63%; le troisième avait perdu 36%.

Cependant, en quatre semaines, la diversité des bactéries intestinales des participants à l'étude était revenue à la normale.

«Que la communauté puisse être gravement perturbée et rebondir est très encourageant », note Dethlefsen, ajoutant que les résultats montrent qu'il n'y a probablement aucune raison pour les personnes en bonne santé de« paniquer »à propos des effets des antibiotiques sur leur système digestif. Le fait que les volontaires n'aient eu aucun problème digestif malgré la profonde altération de leurs bactéries intestinales suggère que d'autres bactéries ont repris le travail des insectes manquants jusqu'à ce que leur population rebondisse, explique-t-il.

Pourtant, les effets sur la santé de effacer certaines bactéries avec un court traitement de Cipro - qui est généralement considéré comme ayant un effet relativement bénin sur les bactéries du système digestif - est inconnu, dit Dethlefsen. Aucune des bactéries qui ont été éliminées, ou dont les populations ont été fortement réduites, n’a aucun effet connu sur la santé humaine, ajoute-t-il.

«Pour moi, cela semble être une étape très précoce dans toute une ligne de recherche qui peut vraiment nous aider à comprendre quelles sont certaines des forces motrices du développement de la diarrhée liée aux antibiotiques, en général, et du C. difficile, en particulier », déclare Marya Zilberberg, MD, professeure à l'Université du Massachusetts, à Amherst, dont la recherche a aidé à montrer que les infections à C. difficile sont de plus en plus courantes - et plus mortelles - aux États-Unis.

En utilisant cette technique, il pourrait être possible d'identifier certaines souches bactériennes qui protègent contre l'infection à C. difficile , et d'autres qui pourraient rendre une personne plus vulnérable, selon le Dr Zilberberg. «Ce n'est qu'un très petit rouage dans une grande roue», dit-elle. «C'est un rouage important, mais ce n'est pas encore proche du consommateur.»

En attendant, le Dr Zilberberg pense que les résultats confirment qu'il est essentiel d'être un «consommateur averti» en matière d'antibiotiques . «Ne dites pas oui à une prescription d'antibiotiques à moins d'être convaincu que vous avez vraiment besoin de ces antibiotiques, car ils ne sont pas sans risque», dit-elle.

Dale Gerding, MD, professeur à Loyola University Chicago, en convient: "Le message est un message que nous disons depuis longtemps - avant de prendre un antibiotique, assurez-vous que vous en avez besoin."

Des recherches antérieures avaient suggéré qu'il y avait peut-être 500 espèces bactériennes dans les intestins, mais des techniques plus sophistiquées montrent maintenant qu'il y en a plus. Le Dr Gerding dit également que l'on soupçonnait depuis longtemps que les antibiotiques détruisent certaines bactéries bénéfiques, ce qui explique pourquoi certaines personnes sont devenues vulnérables au C. difficile.

«Les antibiotiques ne devraient pas être utilisés avec désinvolture simplement parce qu'ils semble être un inconvénient », prévient-il.

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